控制系統采用PLC+PC的監控方式，設置一個中心控制室主站與多個PLC控制分站（如加藥分站、濾池分站和送水分站等），現場分站之間、現場分站與中心控制室主站之間以及中心控制室內的計算機均通過以太網通訊。現場設備的控制分為手動與自動兩種控制方式：手動時PLC監測設備的運行狀態；自動時，PLC監控設備的運行。在自動狀態下，還具有鍵控與自控兩種控制方式：當處于自控控制方式時，現場分站PLC可以監控設備的運行，而中心控制室只能監測設備的運行狀態；當處于監控控制方式時，中心控制室可以監控設備的運行。